Sekolah Dasar Katolik (SDK) Santo Antonius Ampenan didirikan pada tanggal 19 Mei 1966. Sekolah Dasar Katolik (SDK) Santo Antonius Ampenan berada di bawah naungan Yayasan Insan Mandiri Denpasar wilayah Keuskupan Denpasar ini, beralamat Jalan Majapahit No. 9 Phone (0370) 621365 Ampenan 83114 NTB. Tokoh-tokoh yang berperan dalam pendirian awal sekolah ini adalah Mgr. Paulus Antonius Sani, SVD, Perfektur Apostolik Keuskupan Denpasar, Pater Hendricus Gierling, SVD.
Sekolah yang awalnya serba terbatas ini ternyata membawa daya tarik sendiri bagi masyarakat sekitarnya. Awalnya tidak banyak siswa yang mendaftar, namun seiring berjalannya waktu dan meningkatnya animo masyarakat untuk menyekolahkan putra-putrinya di SDK Santo Antonius Ampenan, membuat Yayasan Insan Mandiri Denpasar mengembangkan sekolah ini menjadi dua unit. Hal ini berkaitan erat dengan manajemen sekolah yang tidak profesional lagi bahwa unit sekolah yang dengan jumlah siswanya begitu besar harus dikelola oleh seorang kepala sekolah. Maka pada sekitar tahun 1982, SDK Santo Antonius dibagi menjadi dua, yakni SDK Santo Antonius yang berlokasi di Ampenan yang dipimpin oleh Bapak YB Suparjan dan SDK Santo Antonius yang berlokasi di Cakranegara yang dipimpin oleh Bapak Nyoman Mukra Sukadhana.
Pada tahun 2000 terjadi perubahan nama Yayasan. Semula bernama Swastiastu, kemudian menjadi Insan Mandiri. Namun nama sekolah yang berada di wilayah Yayasan Insan Mandiri Denpasar Cabang Lombok tidak mengalami perubahan nama, tetap seperti semula.
Sejak berdirinya SDK Santo Antonius Ampenan, ada beberapa Kepala Sekolah yang pernah menjabat, yakni:
- Bpk YB Suparjan
- Bpk IGN Wayan Sukarja
- Ibu Yasinta Tanuwijaya
- Bpk Thomas Kt Sutangi
- Bpk Drs Kamilus Wayan Yusa
- Bpk R.Bagus Putra Hariyanto , S.Pd
- Hotrina Saragih, S.Ag
- Renciani Purba, S.Pd (hingga sekarang).